Vejledning til Viper LT

Målgrupper og anvendelsesområde
Definitioner
Fremgangsmåde
Ansvar og organisering
Referencer, lovgivning og faglig evidens samt links hertil
Bilag

Målgrupper og anvendelsesområde
Bioanalytikere, videnskabeligt personale, assistenter og molekylærbiologer.
At sikre korrekt brug af Viper LT platformen.

Definitioner
BD Viper LT-systemet er, når det anvendes sammen med relevante analyser til in vitro-diagnostik (IVD), beregnet til automatisk ekstraktion af nukleinsyrer fra flere forskellige prøvetyper samt amplifikation og påvisning af målnukleinsyresekvenser vha. polymerasekædereaktion (Polymerase Chain Reaction (PCR)).

Fremgangsmåde
Teori:
BD Viper LT-systemet anvender teknologien polymerasekædereaktion (Polymerase Chain Reaction (PCR)) som amplifikationsmetode og fluorescens-energioverførsel (ET) som påvisningsmetode for at teste tilstedeværelsen af patogener i kliniske prøver.
For PCR-analyser skal prøverne logges/scannes ind og gennemgå et forvarmningstrin i BD
Pre-warm heater. I PCR-analysen anvendes pre-warm trinnet til at lysere celler og frigive DNA. Efter pre-warm trinnet anbringes prøverne i BD Viper LT-instrumentet. Den forvarmede prøve overføres til en extraction tube, der indeholder ferrioxidpartikler i en opløselig film. Der tilsættes dernæst syre for at sænke pH-værdien og tilføre positiv ladning til ferrioxiden, som så binder til det negativt ladede DNA. Partiklerne og det bundne DNA trækkes dernæst ud i siderne af extraction tuben vha. magneter, og det ubundne materiale aspireres og bortskaffes i affaldsbeholderen. Partiklerne vaskes, og der tilsættes elueringsbuffer med høj pH-værdi for at isolere det rensede DNA. Til sidst anvendes en neutraliseringsbuffer til at gøre pH-værdien i den ekstraherede opløsning optimal til amplificering.
BD Viper LT-instrumentet overfører ekstraherede prøver samt positive og negative analysekontroller til en PCR plade indeholdende pelleteret mastermix. PCR-pladen forsegles med et plastik seal (en pladeforsegling). Når pladen er forseglet, lukkes den indbyggede Reader (læserlåge) over pladen. Herefter udføres amplifikation og påvisning. BD PCR-analysen er baseret på amplifikation og påvisning af fokus-DNA vha. amplifikationsprimere og en fluorescensmærket detektorprobe. I PCR processen tilsættes den ekstraherede prøve til PCR-pladen, som indeholder amplifikationsprimere, den fluorescensmærkede detektorprobe, varmeaktiveret enzym (Taq DNA-polymerase) og andre reagenser, der er nødvendige for PCR. Resultaterne rapporteres automatisk, baseret på den algoritme, der hører til det analysespecifikke reagens.
Drift tilstande på Viper LT-instrumentet:
Instrumentet har to driftstilstande:
- Vælges tilstanden ”Walkaway” fyldes instrumentet og kørslen startes. Derefter kan instrumentet forlades og kørslen vil automatisk køre til ende. Når kørslen er udført, udskrives en rapport, som viser resultaterne for alle testede prøver, automatisk.
- I tilstanden for høj kapacitet standser instrumentet midlertidigt, når ekstraktionen er færdig, og inden amplifikation/påvisning påbegyndes, så det er muligt at påsætte forbrugsvarer til næste kørsel. I denne tilstand kan prøverne til næste kørsel klargøres/ekstraheres, mens den aktuelle kørsel testes.
Når kørslen er udført, udskrives en rapport, som viser resultaterne for alle testede prøver, automatisk.
Oversigt over BD Viper LT-instrumentet:
BD Viper LT-instrumentets interne moduler: 
- Temperaturkontrol/varmesystem til at kontrollere temperaturer for indbyggede varmeelementer.
- Robotpipetteringsarm til at overføre prøver samt væskehåndtering.
- Den indeholder en 4-stationspipetteringsenhed, der anvendes til at overføre væske mellem M-rør (prøverør), extraction tubes, reagent trough og PCR-pladen. Foruden væskeoverførsel anvender robotten et puncture tool (punkteringsværktøj) for at få adgang til reagent trough med ekstraktionsreagens samt et sæt Seal suction cups (pladeforseglingsværktøjer/sugekopper) til at placere en seal (pladeforsegling) på amplifikationspladen. Når robotarmen er i hvile, befinder den sig bagest til højre inde i instrumentet.
- Puncture tool, reagent trough og forsegling af amp-/PCR-plader.
- Extraction modul, som kemisk ekstraherer DNA fra prøver.
- Prøvelysering og DNA-ekstraktion finder sted i extraction modulet, der er placeret forrest i venstre side af instrument. Der kan være 48 extraction tubes i ekstraktoren, der er udformet i 6 rækker (tal) a 8 kolonner (bogstaver). Magneter hæves og sænkes mellem tubes. DNA bundet til ferrioxiden i extraction tubes holdes mod siderne i tuben, idet prøveaffaldet fjernes og bortskaffes af pipetten. Dernæst fjernes DNA'et fra extraction tubes og overføres til PCR-pladen til PCR-analyse.
- LCD-monitor i farver med touchskærm.
- LCD-monitoren sidder på venstre side af instrumentet. Den består af en 1024 x 1280 pixel farve-LCD og viser oplysninger om instrumentstatus og knapdefinitioner med henblik på udførelse af instrumentfunktioner. Knapdefinitioner og information om status vises hyppigt med ikoner, der repræsenterer den type information eller funktion, der kan udføres. En omfattende liste over instrumentikoner kan ses i fabrikantens manual.
- Indbygget reader til at måle amplifikationsreaktionen og rapportere resultater.
- Readeren, der anvendes i Viper LT Systemet er en selvstændig enhed, der kan udføre PCR i realtid. Readeren indeholder fire optiske kanaler til aflæsning af op til fire fluorescerende farvestoffer i hver reaktionsbrønd. Den anvender filtreret LED-magnetisering og filtreret billedbaseret kameradetektion. Kameraet er monteret over brøndene og aflæser gennem en gennemsigtig sealing, når det anvendes af robotten. Det termiske system omfatter en Peltier-baseret temperaturstyret varmeblok til udførelse af termocycling samt et opvarmet låg til at forhindre, at der dannes kondens på sealingen.
- Fluorescenslæserens optiske system på BD Viper LT-instrumentet består af et kamera med valgbart filter og otte oplyste LED'ere (lysemitterende dioder – to for hver optisk kanal).
Kameraet er en stabil CCD-anordning (Charge-Coupled Device), der ikke kræver direkte kalibrering eller korrektion. LED-oplysningen styres af en kontrolfotodiode i nærheden af PCR-pladens position vha. et aktivt feedback-loop. En sekundær fotodiode, der er placeret i nærheden af den første, sikrer konstant, at LED'erne og kontrolfotodioden fungerer korrekt.
Kalibreringen af readeren består af bestemmelse af korrektionsfaktorer for hver brødposition. Kalibreringen er udført på samme tidspunkt som fremstillingen af maskinen og er ikke ændret, siden forbindelsen fra pladen til kameraet er fikseret.
- Det termiske system omfatter en varmeblok, som passer til PCR plader. Bloktemperaturen styres af 24 termoelektriske celler af Peltier-typen. Disse celler kan enten opvarme eller afkøle afhængigt af vekselstrømmens retning gennem dem. Hver Peltier-cellen har en tilsvarende temperatursensor til temperaturstyring med lukket løkke for hver zone i varmeblokken. Peltier-cellerne deler et fælles kølelegeme i bunden med henblik på at aflede overskydende varme via en tunnelventilator på bagsiden af readeren.
- Computeren, som er ansvarlig for instrumentkontrol, selvkalibrering og brugergrænsefladen.
- Der sidder to stregkodescannere inde i instrumentet: en ved prøvestativstationen og en ved reagent trough. Der findes også en indbygget stregkodescanner på pre-warm stationen, som aflæser stregkoden på prøvestativet. Der medfølger en håndholdt scanner til ind scanning af prøver.
BD Viper LT-instrumentets eksterne moduler:
- Pre-warm Heater.
BD Pre-warm heater anvendes til varmebehandling af prøver og analysekontroller. Varmeelementet er sluttet til BD Viper LT-instrumentet og kommunikerer med instrumentet. Når et prøverack (prøvestativ) (hvor rack og prøver allerede er indscannet) placeres på varmeelementet, scanner stregkodescanneren stregkode på rack og vælger automatisk den korrekte opvarmningsprotokol til den analyse, der er valgt for dette rack. Varmeelementets status opdateres løbende på hovedstatusskærmbilledet i pre-warmvinduet nederst på skærmen. Prøver og analysekontroller skal varmebehandles, inden de kan testes på BD Viper LT-instrumentet.
- Oplyst loginstativ.
Det oplyste loginstativ bidrager til korrekt placering af prøver (M-rør) under indscanning af prøver (prøvelogin). Stativet er tilsluttet BD Viper LT-instrumentet. Inden indscanningen påbegyndes, placeres et rack på det oplyste loginstativ. Rack’et kan kun sættes på loginstationen i én retning. Når en prøve scannes på instrumentet, i skærmbilledet for indscanning af prøver, lyser en blå LED på stationen for at angive, hvor prøven skal placeres. Dette fortsættes, indtil alle prøver er scannet ind og placeret.
Sokkel og prøvejusteringsblokken kan adskilles for at tillade grundig rengøring. Justeringsblokken kan nedsænkes i en opløsning med kloramin efterfulgt af vand. Soklen kan aftørres med kloramin, men må ikke nedsænkes i det. Stationen samles igen ved at placere bunden af justeringsblokken på soklen, mens det sikres, at de 2 styrestifter passer i soklen i de relevante huller i blokken.
- Rack til prøver.
Rack’et anvendes til at opbevare M-rør under funktioner, som f.eks. varmebehandling på pre-warm stationen, afkøling, kørsel i Viper instrumentet osv. Rack’et er beregnet til brug sammen med BD Viper LT-instrumentet.
- Stregkodescanner.
Stregkodescanneren (håndholdt og står på bordet ved Viperen) er designet til at tillade manuel scanning af stregkoder under prøvelogin. Stregkodescanneren bruges til scanning af lotnumre, stativstregkoder og rekvisitions numre på prøver.
BD Viper LT-instrumentets software:
Instrumentsoftwaren præsenterer en forenklet brugergrænseflade på LCD-monitoren med knapper og ikoner, der repræsenterer funktioner, handlinger, indstillingsparametre samt statusinformationer. Rutinemæssige instrumentfunktioner udføres ved at berøre ikonet, der svarer til den ønskede aktivitet.
Der er bl.a. følgende skærmbilleder:
- Hovedstatusskærmbillede – vises, når instrumentet er tændt. Det viser dato og tid, softwareversion, instrumentnummer, status for LIS og låge (låst/oplåst) og status for pre-warm station. Knapperne gør det muligt at få adgang til alle instrumentindstillinger, status og driftsvisninger.
- Skærmbillede for indscanning af prøver – gør det muligt at indtaste/scanne nye racks og prøver.
- Skærmbillede for start af kørsel – gør det muligt at starte kørsler.
- Skærmbillede for kørselsstatus – gør det muligt at overvåge statusinformation om kørslen trinvist og afbryde eventuelle igangværende kørsler.
- Rapportmenu – gør det muligt at udskrive instrumentrapporter, søge efter resultater i henhold til rekvisitions nr (accessionsnummer) og eksportere data for kørsler.
- Skærmbillede for konfiguration/vedligeholdelse – gør det muligt at fortage instrumentindstilling, konfiguration og vedligeholdelsesfunktioner.
- Skærmbillede for instrumentalarmer – viser eventuelle alarmer, der forhindrer instrumentet i at starte en kørsel, og som forekommer under en kørsel.
BD Viper LT-instrumentets racks:
- Racks til prøver.
BD Viper LT-racks anvendes til at holde M-rør godt fast under prøvebehandling. Stativet kan rumme 48 glas i form af 6 rækker (tal 1 – 6) gange 8 kolonner (bogstaver A – H). Denne indretning svarer til indretningen med rækken med bogstaver og kolonne med tal på skærmbilledet login af glas. Prøverne holdes på plads af et låg, som lukkes ned over prøverne, når de alle er placeret i stativet.
Rack’et er mærket med en stregkode, som er placere på låget. Man skal scanne denne stregkode, når rack’et logges ind, for at identificere det. Pre-warm stationens stregkodescanner aflæser denne stregkode med henblik på at vælge den korrekte protokol. Instrumentets faste stregkodescanner aflæser også stregkoden, når den placeres i Viperen for at bekræfte, at rack’et er blevet varmebehandlet.
Rengøring af racks skal ske med en kloramin opsøgning efterfulgt af vand. 
- Extractionracks.
Rack’et består af en stativsokkel og et aftageligt låg, som holder extractiontubes på plads i forbindelse med ekstraktionen.
Låget fjernes ved at skyde det til højre, derefter løfte den venstre ende og fjerne det fra soklen. Låget sættes på plads igen ved at sætte det i åbningen i højre side. Sænk låget ned over soklen, og skyd derefter låget til venstre.
Rengøring af racks skal ske med en kloramin opsøgning efterfulgt af vand. 
Rutinemæssig vedligeholdelse:
Den rutinemæssige vedligeholdelse er opdelt i det daglige, ugentlige og månedlige vedligehold samt efter behov.
Daglig vedligehold:
- Kontrol af printerpapir.
- Kontroller at der er papir i printeren.
- Daily maintenance QC.
- Funktionen for daglig vedligeholdelse er designet til verifikation af cLLD (capacitive liquid level detection) og pipettetryk. Dette gør, at instrumentet kan registrere statussen for robotten/pipetteenheden og bekræfte, at de vigtige funktioner fungerer korrekt. Den daglige vedligeholdelsesfunktion tager omkring 6 minutter at udføre.
- Kørsel af Daily maintenance QC:
Tryk på knappen “konfiguration/vedligeholdelse”.
Tryk på fanen “Tools”.
Tryk på knappen “QC”.
Tryk på menuvalget ”Maintenance - Daily”.
Når funktionen er udført, vises status til højre for menuvalget.
- Pre-warm heater LED QC.
- Funktionen for kvalitetskontrol af pre-warm stationens LED lys tænder alle LED lys på pre-warm stationen. Man skal observere sekvensen for at se, om nogle af LED lysene ikke fungerer. Kvalitetskontrollen tager mindre end et minut at udføre.
- Kørsel af Pre-warm heater LED QC:
Tryk på knappen “konfiguration/vedligeholdelse”.
Tryk på fanen “Tools”.
Tryk på knappen “QC”.
Tryk på menuvalget ”Pre-warm Heater LED QC”.
Når funktionen er udført, vises status til højre for menuvalget.
- Sample login station QC.
- Funktionen for kvalitetskontrol af sample login station oplyser alle LED lys på loginstation efter hinanden. Man skal observere hele sekvensen for at se, om nogle af LED lysene ikke fungerer. Kvalitetskontrol tager mindre end et minut at udføre.
- Kørsel af Sample login station QC:
Tryk på knappen “konfiguration/vedligeholdelse”.
Tryk på fanen “Tools”.
Tryk på knappen “QC”.
Tryk på menuvalget “Sample Login Station QC”.
Når funktionen er udført, vises status til højre for menuvalget.
- End of day clean up.
- Efter hver kørsel tømmes Viper instrumentet for racks og brugte pipette spidser. Det indvendige i maskinen tørres over med en fugtet fnugfri laboratorieserviet med 3 % brintoverilte, efterfulgt af en ny serviet med destilleret eller demineraliseret vand.
Ugentligt vedligehold:
- Weekly maintenance.
- Funktionen for Weekly maintenance kontrollere XYZ-justeringen for alle 4 pipettekanaler. Affaldsblokken bruges som en kendt position, og kanalenderne berører affaldsblokken for at sammenligne værdien med internt lagrede justeringsværdier. Hvis en XYZ-værdi afviger mere end± 0,20 mm fra de interne justeringsværdier, anses kanalen for at ligge uden for justering.
Weekly maintenance omfatter den ugentlige rengøringsprocedure. Hvis der ikke udføres ugentlig vedligeholdelse én gang i løbet af 7 dage, deaktiverer instrumentet funktionen “start kørsel”.
Hver fredag skal pipettespidsstativet og reagensstativet fjernes og rengøres med en kloramin opsøgning efterfulgt af vand.
Weekly maintenance tager omkring 6 minutter at udføre og selve rengøringen af stativer omkring 20 min.
- Kørsel af Weekly maintenance:
Tryk på knappen “konfiguration/vedligeholdelse”.
Tryk på fanen “Tools”.
Tryk på knappen “QC”.
Tryk på menuvalget ”Maintenance - Weekly”.
Når funktionen er udført, vises status til højre for menuvalget.
- Weekly clean up.
- Hver fredag fjernes pipettespidsstativet og reagensstativet fra instrumentet og rengøres. Rengøring af stativerne skal ske med en kloramin opsøgning efterfulgt af vand, hvorefter de lufttørrer til mandag.
- Rengør suction cups og plate sealer station med alkohol wipes.
- Rengør pipette kanalerne med destilleret eller demineraliseret vand. Dette sker under kørsel af programmet ”Weekly maintenance”. Viper instrumentet vil komme med en meddelelse om at maskinen skal slukkes og pipette kanalerne skal rengøres. Rengøringen gøres mens maskinen er slukket.
- Download files.
- Hver mandag overføres filer fra Viper til p drev.
- Sæt et USB-flashdrev i en ledig USB-port.
- Åbn funktionen ”Save Data”.
Vælg de data, du vil eksporter, og angive eventuelle valgfrie.
- Tryk på knappen “gem data til USB”.
- Tryk knappen “Yes” for at bekræfte, at du ønsker at eksportere dataene.
- Alle data gemmes på p drev under ”Viper” mappen, under dagens dato.
Månedlig vedligehold:
- Replace seal suction cups.
- Udskiftes med nye for at forhindre de bliver hårde.
- Replace air filter.
- Fileteret på siden af Viperen fjernes mens maskinen er slukket og erstattes af et rent filter. Det ”gamle” vaskes i alm sæbe og lufttørrer.
- Enviromental.
- Ved ”Enviromental” overvåges tilstedeværelsen af DNA-kontaminering.
En gang om måneden udføres følgende testprocedure for at overvåge arbejdsområdet og udstyrsflader for tilstedeværelse af kontaminering med DNA. Denne overvågning er væsentligt for at påvise kontaminering, inden der opstår et problem.
- 12 forskellige områder testes (for hvert Viper instrument).
- Reagent trough lockdowns
- Extraction rack station
- Sample input station
- Plate seal station
- Priming stage
- Amplification stage
- Door handle
- Monitor touchscreen
- Pre-warm heater
- Lab bench surfaces
- Barcode scanner
- Quick release on waste bottle
- Fremgangsmåde:
- Nukleasefrit vand hældes i et eppendorfrør (eller lignende).
- En steril vatpind dyppes i nukleasefrit vand, og aftører det første område.
- Vatpinden dyppes herefter i en mærket M-rør i 5 – 10 sek. Tryk vatpinden ind langs den indvendige side af røret for at fjerne overskydende væske.
- Herefter fortsættes til alle 12 steder er testet og prøverne køres på Viperen.
- Hvis et område giver et resultat der viser at der er DNA tilstede i prøven (kontamineret), eller hvis der er mistanke om kontamination, rengøres området i henhold til rengøringsanvisningerne. Sørg for, at hele området er vædet med opløsningen og får lov at blive på overfladen i 2 – 3 minutter. Tør området med en ren serviet vædet med vand, og lad det tørre. Test området igen. Gentag rengøringsprocessen, til der ikke længere påvises DNA.
Vedligehold efter behov:
- Tøm affaldsbeholder.
- Affaldsbeholderen skal tømmes inden væsken når op til sensoren.
- Løsn lynkoblingen på affaldsslangen, og fjern affaldsdunken.
- Hæld affaldsvæsken ud i kemikalietanken. Skyl efter med vandhanevand.
- Hæld kloramin eller almindeligt ufortyndet blegemiddel direkte i affaldsflasken.
- Lad den stå i mindst 30 minutter.
- Tøm dunken i kemikalietanken og skyl med vandhanevand.
- Lad dunken stå med bunden i vejret på absorberende materiale natten over.
- Fyld indholdet af en ”Viper Neutralization Pouch” i dunken, og sæt låget på igen.
- Sæt lynkoblingsventilen på affaldsslangen igen, og anbring affaldsdunken ved siden af Viper LT-instrumentet igen.
- Manage Consumables (Administrer forbrugsvarer).
- Funktionen ”Manage Consumables” gør, at du kan udføre robot-/pipette-baserede funktioner, der er relateret til tømning af f.eks. reagent trough og konsolidering af pipettespidser. Funktionerne for administrering af forbrugsvarer kan køres, når robotdelen af en kørsel er færdig, og der ikke eksisterer systemalarmer, for forhindrer dem i at blive udført.
- Kørsel af Manage Consumables:
Tryk på knappen “konfiguration/vedligeholdelse”.
Tryk på fanen “Tools”.
Tryk på knappen “administrer forbrugsvarer”.
Vælg den funktion der ønskes
“Empty Reagent Troughs”
“Empty Reagent Tubes”
“Consolidate Pipette Tips”
- Registrer stregkodescanner.
- Kalibrer touchskærm.
- Pre-warm station QC (Kvalitetskontrol af forvarmer) (termisk verifikation).
- Pre-warm heater QC verificerer opvarmningsfunktionen ved at udføre en opvarmnings- og nedkølingsprotokol. De 6 indbyggede varmeelementer og temperatursensorer (2 pr. varmeelement) for hvert varmeelement verificeres alle. En temperatursensor kontrollerer varmeelementet (primær), og en er en kvalitetskontrolsensor. Temperaturerne mellem hver sensor (primær og kvalitetskontrol) for hvert varmeelement kontrolleres til sidst i opvarmnings- og nedkølingscyklussen. Hvis temperaturforskellen mellem disse to ikke er inden for et acceptabelt område, mislykkes kvalitetskontrollen.
Kvalitetskontrol af forvarmeren tager op til 60 minutter.
- Kørsel af Pre-warm station QC:
Sørg for, at der ikke er prøvestativer i forvarmeren, inden du starter.
Tryk på knappen “konfiguration/vedligeholdelse”.
Tryk på fanen “Tools”.
Tryk på knappen “QC”.
Tryk på menuvalget ” Pre-warm station QC”.
Når funktionen er udført, vises status til højre for menuvalget.
- Magnet QC (Kvalitetskontrol af magnet).
- Prime Heater QC (Kvalitetskontrol af primingvarmeelement).
- Reader QC (Kvalitetskontrol af læser).
- Kvalitetskontrollen af læseren kan udføres for at rydde bestemte systemalarmer. Der kræves ingen opsætning for at udføre denne funktion.
Kvalitetskontrollen tager omkring 9 minutter.
- Kørsel af Reader QC:
Tryk på knappen “konfiguration/vedligeholdelse”.
Tryk på fanen “Tools”.
Tryk på knappen “QC”.
Tryk på menuvalget ”Reader QC”. 
Når funktionen er udført, vises status til højre for menuvalget.
- Robot QC (Kvalitetskontrol af robot).
- Volume QC (Kvalitetskontrol af mængde).
- Rengør vinduet i stregkodescanner.
- Den håndholdte scanner er monteret på en holder, som typisk er placeret i nærheden af monitoren eller på bordet. Hvis scanneren udsteder aflæsningsfejl, mens den forsøger at scanne, kan du prøve at rengøre scannervinduet.
Rengør vinduet med en fnugfri, ikke-slibende klud fugtet med vand.
Anvendelse af Viper instrumentet til Onclarity analyse:
Hver morgen startes med den daglige vedligeholdelse. Er Viper instrumentet fyldt efter en kørsel ”over night” skal instrumentet først tømmes og rengøres.
Herefter køres følgende QC kørsler:
- Daily Maintenance QC
- Pre-warm heater LED QC
- Sample login station QC
Man kontrollerer at der er papir i printeren og afkrydser på check listen under korrekt dato (husk initialer).
Er det tid til ”Weekly” eller ”Monthly” maintenance laves det inden kørsler startes på instrumentet. Husk altid at afkrydse i checklisten.
Når den nødvendige maintenance er udført er instrumentet klar til brug.
Opstart af kørsel:
Prøver skal bringes til stuetemperatur. Kontroller (en positiv og en negativ) forberedes ved at tilsætte indholdet af et M-rør og forsigtigt vende kontrollen.
Kontroller samt prøver indscannes i software og placeres i et rack. Et pladelayout printes, kontrolleres og underskrives med initialer. Dette placeres ved Viper instrumentet til kørslen er færdig.
Rack med kontroller og prøver placeres på pre-warm stationen og pre-warm protokollen startes automatisk. Denne tager ca 60 min.
Efter endt pre-warm placeres rack med kontroller og prøver i Viper instrumentet. Instrumentet fyldes med pipettespidser, extraction tubes, reagent trough, seal og en PCR plade. Tjek at alt er placeret korrekt inden kørslen startes. Instrumentet er indstillet til at vælge ”walkaway” mode som default. Dette betyder at kørslen færdiggøres uden man skal gøre yderligere. Instrumentet vil låses efter start og være låst indtil PCR reaktionen er startet. Herefter vil instrumentet tømme reagent trough, hvorefter lågen til instrumentet låses op og man kan tømme instrumentet. Rack’et med prøver fjernes fra instrumentet og gemmes til kørslen er slut. Skal en prøve køres om tages M-røret fra rack’et og køres om. Er der svar på alle prøver i kørslen kan disse bortskaffes i en ”gul” kasse med biologisk affald. Det tomme reaction trough placeres i den dertilhørende pose, lukkes og bortskaffes i en ”gul” sæk med biologisk affald. Extractin tubes bortskaffes i en "gul" kasse med biologisk affald. Den fyldte pose med pipettespidser fjernes, lukkes og bortskaffes i en ”gul” kasse med biologisk affald. De tomme pipettespids holdere bortskaffes (hård plast). PCR pladen bortkaffes i en ”gul” kasse.
Instrumentet rengøres med en fnugfri klud med brintoverilte efterfuldt af destilleret/demineraliseret vand. Racks rengøres som beskrevet tidligere under de forskellige rack typer.
Pre-warm stationen kan benyttes selv om Viper instrumentet kører. På denne måde kan næste kørsel startes inden den første er færdig. Når instrumentet er låst op og rengjort kan næste kørsel startes. Her fravælges ”Walkaway” mode og instrumentet fyldes med reagenser og pipette spidser. Alt på nær PCR pladen kan fyldes op. Når første kørsel er færdig skal den brugte PCR plade byttes ud med en ny så anden kørsel kan færdiggøres. Viper instrumentet vil låse op og man har et vindue på ca 29 min til at få skiftet pladen.
Efter dagens sidste kørsel tømmes og rengøres instrumentet. Husk at notere på checklisten.
Når en kørsel er færdig vil en rapport automatisk blive udskrevet og prøverne kan besvares i patologi systemet. Er der meldt fejl på en prøve køres denne om en gang. Giver omkørslen ikke et validt resultat besvares prøven ”invalid”.

Ansvar og organisering
Ved alle former for nedbrud kontaktes fagkoordinator.
Skulle der være brug for tekniker hjælp til større nedbrud på platformen kontaktes AXLAB hvis det drejer sig om Viper 2 og 3 mens Medico (og herefter BD) kontaktes for nedbrud på Viper 1.

Referencer, lovgivning og faglig evidens samt links hertil

Bilag
Check list VIPER.docx
Viper LT User Manual_DA.pdf
ViperLT User manuel 2020.pdf