Skæring af FFPE til eksterne molekylære analyser

Målgrupper og anvendelsesområde
Definitioner
Fremgangsmåde
Ansvar og organisering
Referencer, lovgivning og faglig evidens samt links hertil
Bilag

Målgrupper og anvendelsesområde
Bioanalytikere og molekylærbiologer i molekylærlaboratoriet.
Skæring af FFPE væv til molekylær analyser foretages altid af en bioanalytiker tilknyttet molekylær laboratoriet.
FFPE væv skæres på baggrund af patologens ønsker om ekstern molekylær analyse, eller på forespørgsel fra ekstern rekvirent.

Definitioner
De eksterne analyser foretages oftest på Statens Serum Institut (SSI) eller evt andre Klinisk Genetiske afdelinger. Eksterne rekvirenter kan være andre hospitaler eller HNPCC registeret der ønsker FFPE væv til molekylær analyser.

Fremgangsmåde
Sikkerhed:
FFPE væv skæres af bioanalytikere tilknyttet molekylær laboratoriet på den dertil indrettede skræreplads i mol lab.
Der arbejdes med kittel. Handsker bruges ved rengøring med DNA away. Almindelig forsigtighed udvises i forhold til knivbladet på mikrotomen.
Eksterne analyser foretaget på SSI:
Ved ønske om molekylær analyse udført på SSI, udfyldes en rekvisitions blanket der medsendes FFPE vævet. Blanketten findes i laboratoriet (glasburet) eller på SSI's hjemmeside. Blanketten der oftest bruges er Blanket nr 1 (Bakterier) og oftest er den ønskede analyse nr 150 for MTB.
Husk at klarmelde "glasset"/molrøret i patologisystemet.
FFPE til eksterne rekvirenter:
Ved ønske om at få FFPE væv tilsendt fra ekstern rekvirent (kan være andet hospital eller HNPCC registeret), skæres vævet i den tykkelse rekvirenten har opgivet.
Husk at klarmelde "glasset"/molrøret i patologisystemet.
Skæreprocedure:
Rengøring af mikrotom før start:
For at minimere kontamineringsrisiko rengøres rotationsmikrotomen grundigt inden man starter skæring.
Hver gang man starter på en ny omgang skæring rengøres hele mikrotomet samt perkepind/syl med cellestof med DNA AWAY. Herefter tørres alt efter med cellstof med 70% ethanol.
Skæring:
OBS: Eppendorf røret skal være mærket med rekv nr og cpr nr (etikette fra patologi systemet på rekv. niveau)
- Inden man starter sikres det at mikrotomen er ren fra tidligere skæringer.
- Skærens arbejdsplads skal benyttes ved alle skæringer.
- Blok ridses med perkepinden omkring vævsområdet for at mindske paraffinmængden og lægges evt. tilbage på køl.
- Antal snit vurderes ud fra vævets størrelse. Der skæres altid på 10 µm med mindre andet er ønsket fra rekvirenten.
- Nyt knivblad isættes/knivblad flyttes.
- Scan blok og eppendorfrør (1,5 ml eppendorfrør med label fra patologi systemet) og sæt blok i holderen.
- Snit skæres og overføres til det tilhørende eppendorfrør ved hjælp af perkepind eller engangstræpind. Rør lukkes grundigt.
- Skæres der flere blokke på samme patient rengøres mellem HVER blok med 70% ethanol!
- Rør og evt rekvisition afleveres til sekretærene.
- Efter endt skæring af blokke fra en patient rengøres grundtigt. Se nedenstående.
Rengørings procedure imellem skæringer:
- Rotationsmikrotomen rengøres ved at fjerne alle paraffinrester med en støvsuger og tørre overflader grundigt med 70% ethanol.
- Knivholder og blokholder aftørres med cellstof med 70% ethanol. Perkepinden aftørres ligeledes.

Ansvar og organisering

Referencer, lovgivning og faglig evidens samt links hertil

Bilag