Svarafgivelse på molekylære RAS analyser

Målgrupper og anvendelsesområde
Definitioner
Fremgangsmåde
Ansvar og organisering
Referencer, lovgivning og faglig evidens samt links hertil
Bilag
 

 

Målgrupper og anvendelsesområde

Bioanalytikere, videnskabeligt personale, assistenter og molekylærbiologer

At sikre, at alle rekvisitioner besvares korrekt efter gældende regler. Der er altid to personer om at afgive en besvarelse.

Tilbage til top

 

 

Definitioner

Svarafgivelsen sker som besvarelse i molekylær modulet i Patologi systemet

Tilbage til top

 

 

Fremgangsmåde

Svar afgives altid i molekylær modulet i Patologi systemet.

Der afgives kun svar på en analyse hvis svaret opfylder de gældende kvalitetskrav for analysen.

 

KRAS/BRAF/NRAS:

Svar afgives på følgende måde:

Her bruges standardtekster i Patologi systemet til at indikere svaret på analysen. Prøven svares ud til en af vores patologer.

  • Listen over RAS bestillinger kaldes frem i "oversigt/klarmeld" billedet i patologi systemet
  • Svaret på analysen skrives i molekylær modulet, under ”Direkte funktioner” ”Supplering af rekv.” ”Supplerende tekster”
  • Her vælges først det rigtige materiale nr, derefter teksttype som ”Molekylæranalyse” og svaret skrives i ”Supplerende tekst”.  Der skal benyttes standardtekster (se gældende standardtekster) og standard opbygning. (Vigtigt da svaret ikke kan rettes efterfølgende).
  • ”Gem” besvarelsen.
  • Svaret kontrolleres derefter under ”Preview svar” (ALT-W).  Vigtigt at tjekke om materiale nr og blok nr er korrekt! Dette ville ikke kunne rettes efterfølgende.
  • Der sættes en medundersøger på i feltet ”ID2”
  • Status på glas ændres fra ”gl-sk” til ”KLAR”
  • Status på rekv. ændres derefter til ”SUPTG”

 

Standard opbygning af svar:

Blok XXXX:

KRASP eller KRASN

BRAFP eller BRAFN

NRASP eller NRASN

RAS

 

Gældende standardtekster:

KRASN:

Der er ikke påvist mutation i KRAS genet.

KRASP:

Der er påvist mutation i KRAS genet. Mutationen er KRAS<<>>. 

BRAFN:

Der er ikke påvist mutation i BRAF genet.

BRAFP:

Der er påvist mutation i BRAF genet. Mutationen er BRAF<<>>.  Ved supplerende analyse af materialet påvises p.Val600XXX (V600X)

NRASN:

Der er ikke påvist mutation i NRAS genet.

NRASP:

Der er påvist mutation i NRAS genet. Mutationen er NRAS<<>>. 

RAS:

Analysen er udført på Idylla analyseplatform. Analysen undersøger 18 punktmutationer i KRAS (codon 12, 13, 59, 61, 117 og 146), 4 punktmutationer i BRAF (codon 600), samt 16 punktmutationer i NRAS (codon 12, 13, 59, 61, 117 og 146). Detaljeret oversigt over definerede punktmutationer kan fås ved henvendelse på ###EMAIL###.

 

Ved "<<>>" skrives mutationen eks KRAS 12Val

Ved "XXX" og "X" skrives den specifikke BRAF mutation eks  p.Val600Glu (V600E). Den specifikke BRAF mutation aflæses i Idylla Visualizer programmet.

Liste over mutationer kan findes på mutationer.doc

 

MLH1MET/MLH1MET+:

Svar afgives på følgende måde:

Her bruges standardtekster i Patologi systemet til at indikere svaret på analysen. Prøven svares ud til en af vores patologer.

  • Rekvisitionen kaldes frem i "oversigt/klarmeld" billedet i patologi systemet
  • Svaret på analysen skrives i molekylær modulet, under ”Direkte funktioner” ”Supplering af rekv.” ”Supplerende tekster”
  • Her vælges først det rigtige materiale nr, derefter teksttype som ”Molekylæranalyse” og svaret skrives i ”Supplerende tekst”.  Der skal benyttes standardtekster (se gældende standardtekster for MLH1MET/MLH1MET+) og standard opbygning. (Vigtigt da svaret ikke kan rettes efterfølgende).
  • ”Gem” besvarelsen.
  • Svaret kontrolleres derefter under ”Preview svar” (ALT-W).  Vigtigt at tjekke om materiale nr og blok nr er korrekt! Dette ville ikke kunne rettes efterfølgende.
  • Der sættes en medundersøger på i feltet ”ID2”
  • Status på glas ændres fra ”gl-sk” til ”KLAR”
  • Status på rekv. ændres derefter til ”SUPTG” 

 

Standard opbygning af svar:

Vælg en af ndenstående standardtekster

 

Gældende standardtekster:

MLH1MET/MLH1MET+:

MLH1P

Der er foretaget methyleringsanalyse på blok xx.xx.

Der er påvist methylering i det undersøgte materiale.

Analysen er foretaget med EpiMelt MLH1 assay på Rotor Gene Q 5Plex Real time PCR. Analysen detekterer methyleringsstatus i MLH-1 mismatch repair genet.

 

MLH1N

Der er foretaget methyleringsanalyse på blok xx.xx.

Der er ikke påvist methylering i det undersøgte materiale.

Analysen er foretaget med EpiMelt MLH1 assay på Rotor Gene Q 5Plex Real time PCR. Analysen detekterer methyleringsstatus i MLH-1 mismatch repair genet.

 

MLH1INK

Der er foretaget methyleringsanalyse på blok xx.xx.

Analysen er inkonklusiv, og methylering kan ikke vurderes i det undersøgte materiale.

Analysen er foretaget med EpiMelt MLH1 assay på Rotor Gene Q 5Plex Real time PCR. Analysen detekterer methyleringsstatus i MLH-1 mismatch repair genet.

 

Tilbage til top

 

 

Ansvar og organisering

 

 

Referencer, lovgivning og faglig evidens samt links hertil

 

 

Bilag