Heparin eller andre lavmolekylære hepariner (LMWH) kan anvendes da de ikke passerer placenta. Der er således ingen meddelelser om teratogen effekt af heparin eller af LMWH præparater. Ved anvendelse af heparin sent i graviditeten er beskrevet at benzylalkohol, som er blandet i injektionsvæsken, kan give anledning til bilirubinforskydninger i fosterblodet med kernicterus til følge. Derfor foretrækkes LMWH til tromboseprofylakse